祁连圆柏多用播种法繁殖育苗，播种后20天大量出苗，幼苗生长期适当控水炼苗，每隔半个月浇一次透水，每年追肥2～3次，根据树势进行施肥。
1、播种
种植地势平坦、排水良好、土壤肥沃，以壤土为主，背风、背阴、排水的地块种植良好。秋季翻耕，翻匀整平，于3月下旬至4月上旬播种繁殖。
2、密度
祁连圆柏需要经过2～3次的移栽才可培育成绿化大苗。早春3-4月栽植，培育3年再进行移栽，株距30厘米、行距40厘米，再次移栽株行距扩大。
3、养护
祁连圆柏在干旱的季节可以四五天浇水一次，在立春至立秋每隔半月左右施一次肥，入冬前用有机肥，立冬后停肥，北方注意防寒保暖。