沉水植物在水生态修复中有很重要的作用，正是因为这一点，它在生态和景观营造方面备受关注，市场行情也越来越好，栽培种植效果良好。
1、清理原因
随着水体富营养化的加剧，在水中种植一些净化的沉水植物就显得尤为重要了。人工种植的沉水植物具有适应性强、净化能力强的特点，营养丰富的水体也容易滋生杂草，要定期清除，以免影响它的生长。
2、不良影响
但是沉水植物中N、P含量较高，它们生长迅速，繁殖能力强，常会堵塞航道，虽然大部分水生植物对环境友好，但并不意味着可以任其疯长，所以定期打捞很有必要。
3、污染力
沉水植物如果枯萎了，直接烂在水体里了，初期它们的腐烂分解速度较快，但周年腐烂分解率较低，长期在水中漂浮也会造成水体污染，需要加强管理。